Η ΕΣΑΑ στελεχώνεται από στρατιωτικό και πολιτικό προσωπικό και των τριών Κλάδων του Υπουργείου Εθνικής Άμυνας.
Το προσωπικό της ΕΣΑΑ διαθέτει κατάλληλα προσόντα και επαρκή πείρα, ώστε να ανταποκρίνεται στην εκπλήρωση των καθηκόντων του και στην αποστολή της ΕΣΑΑ. Τα ειδικότερα προσόντα και η εργασιακή πείρα του προσωπικού της ΕΣΑΑ καθορίζονται λεπτομερώς στα άρθρα 20 έως 22 του π.δ.85/2020 (Α’198).